Sydney Bristow upptäcker att hennes jobb som agent för SD-6, en topphemlig division av CIA, har hemligheter som hotar säkerheten i den fria världen. Trots att hon varnats för det, avslöjar Sydney sin hemlighet för sin fästman, Danny, som senare blir mördad. Sydney upptäcker att hennes far, Jack, också arbetar för SD-6 och att gruppen inte är en del av CIA, utan faktiskt en fiende till USA. Sydney söker hjälp av det riktiga CIA och värvas som dubbelagent under ledning av operationsofficer Vaughn. Hennes uppdrag nu är att slutföra sina fall på SD-6 samtidigt som hon rapporterar tillbaka sina fynd till CIA. Men när Sydney får reda på att hennes pappa också är ansluten till CIA, börjar hon ifrågasätta var hans sanna lojalitet egentligen ligger.

Källa: TMDb