Thomas herää liikkuvasta tavarahissistä ilman muistikuvia siitä, kuka hän on ja minne hän on menossa. Määränpäässä häntä odottaa joukko poikia, jotka ovat jo kolme vuotta asuneet omavaraisessa kyläyhteisössä aukiolla, suuren muurin ympäröimänä. Aukiota ympäröivä muuri ei ole mikä tahansa muuri, se on Labyrintti. Joka päivä muutama pojista lähtee kartoittamaan labyrintin alati muuttuvaa rakennetta löytääkseen mahdollisen ulospääsyn. Labyrintin aukionpuoleinen portti sulkeutuu joka yö, eikä yötä ole vielä kukaan selvinnyt hengissä jäätyään portin väärälle puolelle. Thomasin tulo mullistaa asioita, sillä jo muutaman päivän oleskelun jälkeen hän näkee asiat toisin kuin muut. Thomaksesta Labyrintti tuntuu jotenkin tutulta, vaikka hän ei täysin ymmärräkään miksi. Eräänä päivänä hissistä löytyy tyttö. Ensimmäinen laatuaan ja mukana tulleen viestin mukaan, myös viimeinen aukiolle koskaan saapuva henkilö. Ajat tulevat muuttumaan.

Lähde: TMDb